Un nou entreteniment anomenat futbol arriba a Vila-real de la mà de José Calduch, qui durant els seus estudis de Medicina a Barcelona queda sorprés d'este popular esport i decidix importar a la seua ciutat natal perquè tots puguen gaudir-lo. De tal mode, el 10 de març de 1923, en la rebotiga de la farmàcia familiar, José Calduch funda el CD Villarreal, precursor de l'actual Villarreal CF. El mateix any, compra una partida agrícola i la convertix en el Camp del Villarreal, posteriorment denominat El Madrigal.

Fruit de la ràpida popularitat que adquirix el futbol, el CD Villarreal comença a prendre rellevància i a disputar els seus primers enfrontaments. El 15 de desembre de 1935, l'equip vila-realenc, amb samarreta blanca i pantalons negres, es proclama campió regional, però la Guerra Civil Espanyola acaba abruptament amb qualsevol indici de competició esportiva a la ciutat.

Després de la Guerra Civil i la consegüent desaparició del CD Villarreal, el futbol sobreviu a la ciutat gràcies a les penyes locals. En esta etapa convulsa i repleta de canvis, l'equip d'una d'estes penyes destaca per damunt de la resta: el Club Atlético Foghetecaz:. A més, en 1944, l'Ajuntament compra les instal·lacions passant a ser un camp municipal. Este ambient futbolístic es veu culminat en 1947, quan l'equip fa un pas decisiu i s'inscriu en la Federació Valenciana amb un nom que representa a la ciutat: CAF Villarreal. Al poc temps, el club aconseguix el primer Campionat Regional d'Aficionats.

El Villarreal CF canvia la seua denominació a l'actual, que ha mantingut fins als nostres dies. Dona un gir a la seua indumentària, incorporant la samarreta groga i pantalons i mitjanes blaves amb voltes grogues. L'ascens per primera vegada a Tercera Divisió obri la porta a l'arribada de jugadors estrangers. En 1952, El Madrigal patix una de les primeres grans reformes, prenent com a referència l'Estadi Olímpic de Hèlsinki.

El Villarreal CF ascendix de nou a Tercera i aconseguix un èxit impensable fins a la data: certificar el seu primer ascens a Segona Divisió enfront del Bilbao Athletic en el Santiago Bernabéu. L'alegria de la primera d'estes dos gestes crea himnes que acompanyen al club fins als nostres dies.

El Submarí travessa moments difícils. Toca fons amb un dur descens a Regional Preferent, encara que s'alça guanyant el Campionat Regional d'Aficionats i aconseguint un nou ascens a Tercera Divisió. En esta etapa, comença disputar amistosos enfront de rivals estrangers com el Gwardia Varsòvia de Polònia. Este últim compta amb l'estrena de llum artificial, encara que en partit oficial serà contra la UD Ibiza.

El Villarreal diu adeu al futbol regional. Jugadors de la talla d'Adriano, Nadal o Honorio es convertixen en estendards del club i guien a l'equip de nou fins al futbol de plata. Este període està marcat per dos ascensos. Un a Segona Divisió B i un altre que comporta l'històric retorn a Segona Divisió. L'alegria inunda tant els carrers de Vila-real com les graderies, repletes d'aficionats grocs, en la Línea de la Concepción.

Amb l'aparició de José Manuel Llaneza, que recala al Villarreal de la mà de Font de Mora, i l'arribada de Fernando Roig com a màxim accionista, el Villarreal CF aconseguix una gesta impossible: aconseguir la Primera Divisió i consolidar-se en l'elit del futbol espanyol. El club creix a velocitat de creuer i es professionalitza impulsat per una gestió modèlica. El Madrigal s'adapta als nous temps. Es construïx la Ciutat Esportiva i arriben els primers ‘cracks’ mundials.

El Villarreal impressiona al futbol europeu. Es convertix en un equip competitiu en LALIGA i en un contendent habitual en competicions continentals gràcies a l'aportació de llegendes com Riquelme, Forlán, Cazorla, Senna o Bruno. Durant esta etapa, s'enfronta a grans potències del futbol europeu com el Manchester United, l'Arsenal i l'Inter de Milán. Alça dos Intertoto, aconseguix una semifinal de Champions League i dos d'Europa League. També es proclama subcampió en LALIGA.

El Villarreal viu un somni que acaba tornant-se en malson. Els groguets perden la categoria de manera inesperada en 2012 per a tornar només un any després.

Després de l'inesperat descens de categoria, el Villarreal es veu obligat a reconstruir-se per a tornar amb més força. Liderat per Fernando Roig Negueroles, el Submarí torna a Primera Divisió, s'assenta de nou en l'elit i torna a convertir-se en un equip d'Europa. Encara que esta vegada no sols per a competir, sinó per a aconseguir la glòria de la mà de Unai Emery. La conquesta de l'Europa League en 2021 i unes noves semifinals de Champions League en 2022 tornen a meravellar al planeta futbol. Es complix el centenari del club i l'Estadio de la Cerámica experimenta un impressionant projecte de reforma.