Después de transitar muchos años en Tercera y categorías regionales, el Villarreal CF consiguió dar un golpe de efecto que le relanzó. Bajo la presidencia de Pascual Font de Mora, el equipo logró ascender dos categorías en dos años consecutivos. El ‘Submarino Amarillo’ consiguió el ascenso de Tercera a Segunda División B en la 1990-91 después de finalizar segundo en la temporada regular con 48 puntos (17 victorias, 14 empates y solo 3 derrotas; 57 goles a favor y 26 en contra). En la fase de ascenso, los amarillos arrasaron ante los rivales -Imperial de Murcia, CD Cala d’Or y CF Balaguer- con cinco victorias y apenas una derrota.

Fase de ascenso a Segunda División B:

• Imperial 0-1 Villarreal (18/05/91). Gol de Honorio.
• Villarreal 8-1 Cala d’Or (26/05/91). Goles de Honorio (2), Nadal, Planelles (2), Aparicio y Quemades (2).
• Balaguer 2-1 Villarreal (02/06/91). Gol de Nadal.
• Villarreal 1-0 Imperial (09/06/91). Gol de Nadal.
• Villarreal 3-0 Balaguer (16/06/91). Goles de Honorio, Aparicio y Latorre.
• Cala d’Or 2-3 Villarreal (23/06/91). Goles de Emilio, Latorre y Aparicio.

El Villarreal CF quedó campeón del grupo, con 10 puntos y ascendió a Segunda División B.

En la 1991-92, el equipo repitió la hazaña y volvió a la categoría de plata del fútbol español. En el Grupo 3, el Villarreal finalizó en la segunda plaza en la temporada regular con 51 puntos (19 victorias, 13 empates y 6 derrotas; 61 goles a favor y 39 en contra) y logró disputar la promoción de ascenso, en la que se hizo con el liderato de la promoción ante la UD Salamanca, Girona FC y RB Linense.

Fase de ascenso a Segunda División:

• Girona 1-2 Villarreal (31/05/92). Goles de Julio Pérez y Adriano.
• Villarreal 2-1 Salamanca (03/06/92). Goles de Mateu y Planelles.
• Salamanca 2-0 Villarreal (07/06/92).
• Villarreal 2-4 Girona (15/06/92). Goles de Mateu y Alcañiz.
• Villarreal 1-0 Linense (21/06/92). Gol de Adriano.
• Linense 1 Villarreal 2 (28/06/92). Goles de Alcañiz y Reyes.

El Villarreal CF quedó campeón del grupo con 8 puntos y certificó el ascenso a Segunda División.

Tras recuperar la categoría de plata, el Submarino ya no abandonará la Segunda División hasta la gesta heroica del ascenso a Primera División en la 1997-98.